Leki skutecznie tłumią objawy chorób alergicznych i astmy, natomiast immunoterapia, poprzez modyfikację zaburzonych w alergii funkcji układu odpornościowego, hamuje ewolucję choroby (np. rozwój astmy oskrzelowej u chorego na alergiczny nieżyt nosa).
Zobacz: Lista leków stosowanych w chorobach alergicznych, Immunoterapia alergenowa, Skuteczność immunoterapii alergenowej, Doustne szczepionki alergenowe.
Najważniejszą cechą immunoterapii, która odróżnia ten sposób leczenia od farmakoterapii, czyli stosowania leków, jest działanie przyczynowe (leczenie alergii, która jest przyczyną objawów choroby). Immunoterapia ingeruje w podstawowy mechanizm alergii i „odczula” organizm na działanie alergenu, natomiast leki tłumią skutki reakcji alergenowej w ustroju, a więc objawy choroby.
Immunoterapia jest zatem przyczynowym leczeniem choroby, natomiast stosowanie leków jest postępowaniem objawowym.
Nie u wszystkich chorych immunoterapia dostatecznie łagodzi objawy choroby, czy też powoduje ich trwałe ustąpienie. U wielu chorych konieczne jest również stosowanie leków. Dlatego też skuteczność immunoterapii mierzy się stopniem zmniejszenia nasilenia objawów i zmniejszeniem zapotrzebowania na dotychczas stosowane leki. Jest to wymierna korzyść ze stosowania szczepionek alergenowych.
Te dwa sposoby leczenia chorób alergicznych nie wykluczają się a wręcz uzupełniają wzajemnie, gdyż mają różne mechanizmy działania.